英国ハンプシャー州に、サンドルフォード繁殖地というウサギたちの巣穴があった。ある日、そこに棲むウサギで予知能力をそなえたファイバーがこの地に災害が迫っていることを予言。彼の兄であり、彼の“能力”を認めているヘイズルは村の長に避難を提案したもののとりあってもらえず、上士（幹部）頭ビグウィグの助けも借りながら何羽かのウサギたちと村を脱出する――。
人間たちによる「喰われるためだけ」の養兎場、将軍による「軍国主義的な統制」を敷く繁殖地･･･、理想郷を探す彼らの旅の前に立ちふさがるのは予想もしない世界だった。
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